Les équipes

Étude et synthèse de peptides pour lutter contre la résistance des bactéries à Gram-négatif. Contact : Alexandra DASSONVILLE-KLIMPT. Mots clé : antibactérien, antipaludique, résistance, interactions peptide/membrane, vectorisation

Utilisation de peptides antimicrobiens dans la protection de surface contre la prolifération de biofilms ; nous produisons et utilisons également les PAMs en biotechnologie pour produire des protéines (solubles-membranaires)/vésicules d’intérêt. Contact : Vincent HUMBLOT. Mots clé : biointerfaces, lab-on-chip/organ-on-chip, dispositifs microfluidiques

Nous élaborons des matériaux et des revêtements innovants antimicrobiens, anti-inflammatoires et antiviraux et évaluons leurs applications dans le cadre des dispositifs médicaux implantables et non-implantables en utilisant des assemblages supramoléculaires de biopolymères et de peptides. Contact : Philippe Lavalle Mots clé : Biomatériaux / Antimicrobiens / Biopolymères / Matériaux avancés et intelligents

(i) formation des défenses naturelles de l’œuf de poule, (ii) leur évolution en fonction des conditions d’élevage et au cours du stockage et/ou de l’incubation, et à (iii) l’identification et la caractérisation des protéines et peptides antimicrobiens présents dans les différents compartiments de l’œuf. Contact : Nicolas GUYOT. Mots clé : œuf de consommation, œuf à couver, qualité sanitaire, protéines et peptides antimicrobiens, défensines

Recherche de peptides naturels ou synthétiques à activités anti-bactériennes, anti-résistance anti-biofilm, anti-virulence et anti-inflammatoire et étude de leur mécanisme d’action. Contact : Olivier LESOUHAITIER. Mots clé : Biofilm, membrane bactérienne, ESKAPEE, antibio-résistance, stratégies anti-infectieuses

Nos projets portent sur les structures 3D par RMN, les relations structure-fonction, et les mécanismes d’action de peptides antimicrobiens riches en ponts disulfure, en particulier les défensines. La métabolomique par RMN et la microscopie de fluorescence complète notre expertise initiale de biologie structurale. Contact : Céline LANDON. Mots clé : Defensine, RMN, biologie structurale, relation structure-activité, mécanisme d’action, microscopie de fluorescence

Effets des agents antimicrobiens sur les surfaces microbiennes à l’échelle nano par AFM. Contact : Sofiane EL-KIRAT-CHATEL. Mots clé : Propriétés des surfaces microbiennes, spectroscopie de force de la molécule unique, spectroscopie de force de la cellule unique, AFM

Conception bio-inspirée d’architectures moléculaires, mimes de PAMs, pour combattre les infections bactériennes. Contact: Sophie FAURE. Mots clé : Peptidomimétiques, Foldamères, Antimicrobiens

Rôle des PAMs de Xenorhabdus/Photorhabdus, bactéries entomopathogènes vivant en symbiose avec des nématodes du sol, dans le cadre de leur utilisation en biocontrôle contre des insectes ravageurs de culture. Contact : Alyssa Carré-Mlouka. Mots clé : bactéries entomopathogènes, nématodes, écologie microbienne, métabolites spécialisés NRPS, interactions.

Analyse de la réponse immunitaire innée d’organismes non-modèles et caractérisation du mode d’action de peptides antimicrobiens ainsi nouvellement identifiés. Contact : Julien VERDON. Mots clé : Lutte biologique, Legionella pneumophila, mécanisme d’action, data mining, insectes et crustacés

Nous utilisons la spectroscopie RMN du solide et du liquide ainsi que des simulations de dynamique moléculaire pour fournir une description détaillée du mécanisme d'action des peptides antimicrobiens et anticancéreux ciblant les membranes biologiques. Contact : Nicola D’AMELIO. Mots clé : RMN, Dynamique moléculaire, biologie structurale, membranes

Notre équipe étudie les dicétopipérazines, qui sont constitués de deux acides aminés cyclisés et modifiés, et présentent diverses activités biologiques. Contact : Céline AUBRY. Mots clé : Dicétopipérazines, CDPS, ARNt, cytochromes P450

Fonctionalisation de nanoparticules pour des applications biomédicales, par exemple avec des peptides antimicrobiens. Contact: Cécilia MENARD-MOYON. Mots clé : Nanoparticules, fonctionnalisation, autoassemblage, hydrogels, applications biomédicales

Caractérisation structurale et fonctionnelle de PAM d’amphibien et valorisation en tant qu’agents thérapeutiques. Contact : Ali LADRAM. Mots clé : Amphibiens – dermaseptines – temporines – relation structure-activité – mécanisme d’action

Chimie thérapeutique en lien avec des cyclopeptides isolés de plantes, possédant de fortes activités antivirales sur un large panel de virus tels que le ZIKV, DENV et CHIKV. Contact: Sandy DESRAT. Mots clé : Produits Naturels, Phytochimie, Chimie thérapeutique, Synthèse totale, Synthèse peptidique supportée

Pathovars de Escherichia coli et E. coli commensaux et probiotiques : interactions au sein du microbiote intestinal, notamment par le biais de peptides anti-microbiens tels que les sidérophore-microcines. Contact : Frédéric AUVRAY et Sophie DUQUESNE. Mots clé : Escherichia coli, commensalisme, pathogénicité, microcines, microbiote intestinal

Identification et caractérisation de molécules naturelles et/ou synthétiques possédant des activités thérapeutiques (antibactérienne, antifongique, anticancéreuse, anti-inflammatoire). Contact : Marc MARESCA. Mots clé : interface chimie-biologie, peptides, peptidomimétiques, activités thérapeutiques

Criblage / quantification in vitro d’activité antiparasitaire (anticoccidienne et anti-cryptosporidium). Contact : Anne SILVESTRE. Mots clé : Eimeria / Cryptosporidium / peptides antimicrobiens / immunité innée

Modèles d’infection par Salmonella chez le poulet et chez la souris, in vitro (lignées cellulaires et cellules primaires), ex vivo (enteroïdes), et in vivo pour tester des PAMs. Contact : Anne-Christine LALMANACH. Mots clé : Gallus gallus, Mus musculus, immunité intestinale, Salmonella, infection

Interactions peptides / membranes : approches structurales visant à la fois le peptide et les molécules qui l’entourent. Contact : Dror WARSCHAWSKI. Mots clé : Structure, Membranes, RMN, Spectrométrie de masse, Fluorescence

Caractérisation des activités de molécules produites par des bactéries marines : antibactériens, antibiofilms et anticancéreux. Contact : Sophie Sablé. Mots clé : antibactérien, antibiofilm, bactériocines, NRPS, bactéries marines

Peptides antimicrobiens d’origine bactérienne : structures, biosynthèse, relations structure-activité, mécanismes de résistance et potentiel en tant qu’alternative thérapeutique face à la crise actuelle de résistance aux antibiotiques. Contact : Séverine ZIRAH. Mots clé : bactériocines, peptides d’origine ribosomale portant des modifications post-traductionnelles (RiPPs), peptides d’origine non ribosomale, biosynthèse, microbiote intestinal

Nous développons des nouveaux peptides antimicrobiens contre les bactéries persistantes responsables des infections chroniques. Contact : Pierre ROCHETEAU. Mots clé : bactéries persistantes, infections chroniques, molécules antipersister, immunostimulation

L’équipe SymSIm cherche à comprendre comment le système immunitaire innée de l’insecte aurait évolué pour à la fois tolérer la présence de symbiotes dans certaines cellules, tout en maintenant ce partenaire bactérien sous contrôle, grâce en partie à des peptides antimicrobiens. Contact : Carole Vincent-Monegat Mots clé : symbiose, insectes, AMP, immunité